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デルタとオミクロンの混合変異株「デルタクロン」を確認 イギリスの変異株とは別系統?オーストラリア


イギリスに続いて今度はオーストラリアでも新型コロナウイルスの新たな変異株が報告されました。
この変異株はイギリスの変異株と同じようにデルタ株とオミクロン株の特性を両方とも持っているもので、その構造から「Deltaacro(デルタクロン)」とも呼ばれています。

イギリスで発見された変異株とは違う組み換え部分もあることから、イギリスとは完全に別系統で独自の変異をしたものである可能性が高いとのことです。
現在は新規感染者数が極一部に限定されているとしていますが、オミクロンの初期段階と似たような部分があるとして、これからさらなる感染拡大を誘発しないか研究機関が監視を強めています。
*イギリスの保健当局も危険な変異株として監視リストに追加

 

Australia: possible Queensland Deltacron cluster identified
https://www.coronaheadsup.com/science/variants/deltacron/australia-possible-queensland-deltacron-cluster-identified/

We’ve seen several sequences collected early this year in Queensland, Australia being called Omicron unassigned by Pangolin and show similar patterns: ORF1ab mutations are more like from Delta with high alternate freq. However they’re far away from the aforementioned UK sequences (>20 SNPs):

Australia/QLD5084/2022 (Illumina)
Australia/QLD39476/2022 (ONT low qual.)
Australia/QLD37984/2022 (Illumina)
Australia/QLD0x00C42F/2022 (Illumina)

Not all of them are available on GISAID so here is the FASTA and VCF

A rough analysis based on scorpio haplotype of above 4 UK sequences and these 4 QLD sequences using AY.4 and BA.1 constellations:

Small Australian cluster (7 seq) of potential Delta-Omicron recombinants #437
https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/437

 

 

関連過去記事

【緊急】デルタとオミクロンのハイブリッド変異株を確認!イギリス保健当局が監視リストに!
https://johosokuhou.com/2022/02/13/55806/

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